Protein–RNA interactions for Protein: O14709

ZNF197, Zinc finger protein 197, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF197O14709 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF197O14709 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF197O14709 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF197O14709 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF197O14709 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF197O14709 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF197O14709 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF197O14709 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF197O14709 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF197O14709 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF197O14709 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF197O14709 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF197O14709 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF197O14709 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF197O14709 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF197O14709 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF197O14709 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF197O14709 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF197O14709 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms