Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

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Length 899 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRRT4C9JH25 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRRT4C9JH25 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRRT4C9JH25 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRRT4C9JH25 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRRT4C9JH25 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRRT4C9JH25 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PRRT4C9JH25 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRRT4C9JH25 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRRT4C9JH25 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRRT4C9JH25 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRRT4C9JH25 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRRT4C9JH25 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRRT4C9JH25 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PRRT4C9JH25 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRRT4C9JH25 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRRT4C9JH25 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PRRT4C9JH25 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRRT4C9JH25 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRRT4C9JH25 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRRT4C9JH25 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRRT4C9JH25 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRRT4C9JH25 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRRT4C9JH25 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRRT4C9JH25 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRRT4C9JH25 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PRRT4C9JH25 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PRRT4C9JH25 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRRT4C9JH25 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRRT4C9JH25 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRRT4C9JH25 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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