Protein–RNA interactions for Protein: A8MUI8

Putative UPF0607 protein ENSP00000383783, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MUI8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A8MUI8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A8MUI8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A8MUI8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A8MUI8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A8MUI8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A8MUI8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A8MUI8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A8MUI8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A8MUI8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
A8MUI8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
A8MUI8 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A8MUI8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A8MUI8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A8MUI8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A8MUI8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A8MUI8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A8MUI8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A8MUI8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A8MUI8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A8MUI8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
A8MUI8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A8MUI8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
A8MUI8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
A8MUI8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
A8MUI8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A8MUI8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
A8MUI8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A8MUI8 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
A8MUI8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A8MUI8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A8MUI8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A8MUI8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
A8MUI8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A8MUI8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A8MUI8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A8MUI8 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A8MUI8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
A8MUI8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A8MUI8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A8MUI8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A8MUI8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
A8MUI8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
A8MUI8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
A8MUI8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
A8MUI8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
A8MUI8 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A8MUI8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
A8MUI8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
A8MUI8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A8MUI8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
A8MUI8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
A8MUI8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
A8MUI8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
A8MUI8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
A8MUI8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
A8MUI8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
A8MUI8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
A8MUI8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
A8MUI8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
A8MUI8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
A8MUI8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
A8MUI8 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
A8MUI8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
A8MUI8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
A8MUI8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
A8MUI8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
A8MUI8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
A8MUI8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
A8MUI8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
A8MUI8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
A8MUI8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
A8MUI8 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
A8MUI8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
A8MUI8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
A8MUI8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A8MUI8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A8MUI8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A8MUI8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
A8MUI8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A8MUI8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
A8MUI8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A8MUI8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
A8MUI8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A8MUI8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
A8MUI8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
A8MUI8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A8MUI8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A8MUI8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
A8MUI8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
A8MUI8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A8MUI8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
A8MUI8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A8MUI8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A8MUI8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A8MUI8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
A8MUI8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A8MUI8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A8MUI8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A8MUI8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms