Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA6BA6NDN3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA6BA6NDN3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA6BA6NDN3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA6BA6NDN3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6BA6NDN3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6BA6NDN3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6BA6NDN3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6BA6NDN3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6BA6NDN3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6BA6NDN3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6BA6NDN3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6BA6NDN3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6BA6NDN3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6BA6NDN3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6BA6NDN3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6BA6NDN3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6BA6NDN3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6BA6NDN3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6BA6NDN3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6BA6NDN3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6BA6NDN3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6BA6NDN3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6BA6NDN3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6BA6NDN3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6BA6NDN3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6BA6NDN3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6BA6NDN3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6BA6NDN3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6BA6NDN3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6BA6NDN3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6BA6NDN3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6BA6NDN3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6BA6NDN3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6BA6NDN3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6BA6NDN3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6BA6NDN3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6BA6NDN3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6BA6NDN3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6BA6NDN3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6BA6NDN3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6BA6NDN3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6BA6NDN3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6BA6NDN3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6BA6NDN3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6BA6NDN3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6BA6NDN3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6BA6NDN3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6BA6NDN3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6BA6NDN3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6BA6NDN3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6BA6NDN3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6BA6NDN3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6BA6NDN3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6BA6NDN3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6BA6NDN3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6BA6NDN3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA6BA6NDN3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA6BA6NDN3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA6BA6NDN3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA6BA6NDN3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6BA6NDN3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms