Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQD8

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PQD8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A1W2PQD8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
A0A1W2PQD8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1W2PQD8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1W2PQD8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1W2PQD8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1W2PQD8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1W2PQD8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1W2PQD8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1W2PQD8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1W2PQD8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1W2PQD8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1W2PQD8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1W2PQD8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1W2PQD8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1W2PQD8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1W2PQD8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1W2PQD8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
A0A1W2PQD8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1W2PQD8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1W2PQD8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1W2PQD8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1W2PQD8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1W2PQD8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1W2PQD8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1W2PQD8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1W2PQD8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1W2PQD8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1W2PQD8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1W2PQD8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1W2PQD8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1W2PQD8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1W2PQD8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A0A1W2PQD8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A1W2PQD8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A1W2PQD8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A1W2PQD8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A1W2PQD8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A1W2PQD8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A1W2PQD8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A0A1W2PQD8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1W2PQD8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1W2PQD8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1W2PQD8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1W2PQD8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1W2PQD8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1W2PQD8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1W2PQD8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1W2PQD8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1W2PQD8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1W2PQD8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1W2PQD8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1W2PQD8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A0A1W2PQD8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1W2PQD8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1W2PQD8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1W2PQD8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1W2PQD8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1W2PQD8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1W2PQD8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1W2PQD8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1W2PQD8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1W2PQD8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1W2PQD8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1W2PQD8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1W2PQD8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1W2PQD8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A0A1W2PQD8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1W2PQD8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1W2PQD8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1W2PQD8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1W2PQD8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1W2PQD8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1W2PQD8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1W2PQD8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1W2PQD8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1W2PQD8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1W2PQD8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1W2PQD8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1W2PQD8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1W2PQD8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1W2PQD8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1W2PQD8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A0A1W2PQD8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1W2PQD8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1W2PQD8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1W2PQD8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1W2PQD8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1W2PQD8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1W2PQD8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1W2PQD8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1W2PQD8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1W2PQD8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1W2PQD8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1W2PQD8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A0A1W2PQD8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A1W2PQD8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A1W2PQD8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A1W2PQD8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A0A1W2PQD8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms