Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

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Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HCN4Q9Y3Q4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HCN4Q9Y3Q4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HCN4Q9Y3Q4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HCN4Q9Y3Q4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HCN4Q9Y3Q4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HCN4Q9Y3Q4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HCN4Q9Y3Q4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HCN4Q9Y3Q4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HCN4Q9Y3Q4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HCN4Q9Y3Q4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HCN4Q9Y3Q4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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HCN4Q9Y3Q4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HCN4Q9Y3Q4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
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