Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ7

SCP2D1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2D1Q9UJQ7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SCP2D1Q9UJQ7 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCP2D1Q9UJQ7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms