Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DNMT3BQ9UBC3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 290.8 ms