Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP36Q9P275 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP36Q9P275 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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