Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
EHD3Q9NZN3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EHD3Q9NZN3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms