Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL2

ARHGEF38, Rho guanine nucleotide exchange factor 38, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF38Q9NXL2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARHGEF38Q9NXL2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARHGEF38Q9NXL2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms