Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CCDC90BQ9GZT6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC90BQ9GZT6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms