Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HDAC8Q9BY41 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HDAC8Q9BY41 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HDAC8Q9BY41 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms