Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWS9

CHID1, Chitinase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHID1Q9BWS9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHID1Q9BWS9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHID1Q9BWS9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHID1Q9BWS9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHID1Q9BWS9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHID1Q9BWS9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHID1Q9BWS9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHID1Q9BWS9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHID1Q9BWS9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHID1Q9BWS9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CHID1Q9BWS9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHID1Q9BWS9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHID1Q9BWS9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHID1Q9BWS9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHID1Q9BWS9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHID1Q9BWS9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHID1Q9BWS9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHID1Q9BWS9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHID1Q9BWS9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHID1Q9BWS9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHID1Q9BWS9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHID1Q9BWS9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHID1Q9BWS9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms