Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVR0

HERC2P3, Putative HERC2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2P3Q9BVR0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HERC2P3Q9BVR0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms