Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP1

PDCD2L, Programmed cell death protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2LQ9BRP1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDCD2LQ9BRP1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDCD2LQ9BRP1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PDCD2LQ9BRP1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PDCD2LQ9BRP1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDCD2LQ9BRP1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDCD2LQ9BRP1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDCD2LQ9BRP1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDCD2LQ9BRP1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDCD2LQ9BRP1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDCD2LQ9BRP1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDCD2LQ9BRP1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDCD2LQ9BRP1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDCD2LQ9BRP1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDCD2LQ9BRP1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PDCD2LQ9BRP1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDCD2LQ9BRP1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDCD2LQ9BRP1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDCD2LQ9BRP1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PDCD2LQ9BRP1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDCD2LQ9BRP1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDCD2LQ9BRP1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDCD2LQ9BRP1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDCD2LQ9BRP1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDCD2LQ9BRP1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDCD2LQ9BRP1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDCD2LQ9BRP1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDCD2LQ9BRP1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDCD2LQ9BRP1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDCD2LQ9BRP1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDCD2LQ9BRP1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDCD2LQ9BRP1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDCD2LQ9BRP1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDCD2LQ9BRP1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDCD2LQ9BRP1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDCD2LQ9BRP1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDCD2LQ9BRP1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDCD2LQ9BRP1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PDCD2LQ9BRP1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDCD2LQ9BRP1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDCD2LQ9BRP1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDCD2LQ9BRP1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PDCD2LQ9BRP1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDCD2LQ9BRP1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDCD2LQ9BRP1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDCD2LQ9BRP1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDCD2LQ9BRP1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDCD2LQ9BRP1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDCD2LQ9BRP1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDCD2LQ9BRP1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDCD2LQ9BRP1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDCD2LQ9BRP1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDCD2LQ9BRP1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDCD2LQ9BRP1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDCD2LQ9BRP1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDCD2LQ9BRP1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDCD2LQ9BRP1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDCD2LQ9BRP1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PDCD2LQ9BRP1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDCD2LQ9BRP1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDCD2LQ9BRP1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDCD2LQ9BRP1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDCD2LQ9BRP1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDCD2LQ9BRP1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PDCD2LQ9BRP1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDCD2LQ9BRP1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDCD2LQ9BRP1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDCD2LQ9BRP1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDCD2LQ9BRP1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDCD2LQ9BRP1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDCD2LQ9BRP1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PDCD2LQ9BRP1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDCD2LQ9BRP1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDCD2LQ9BRP1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDCD2LQ9BRP1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDCD2LQ9BRP1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDCD2LQ9BRP1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDCD2LQ9BRP1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDCD2LQ9BRP1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDCD2LQ9BRP1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDCD2LQ9BRP1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDCD2LQ9BRP1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDCD2LQ9BRP1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDCD2LQ9BRP1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDCD2LQ9BRP1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PDCD2LQ9BRP1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDCD2LQ9BRP1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDCD2LQ9BRP1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDCD2LQ9BRP1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDCD2LQ9BRP1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDCD2LQ9BRP1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDCD2LQ9BRP1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PDCD2LQ9BRP1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDCD2LQ9BRP1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDCD2LQ9BRP1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDCD2LQ9BRP1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDCD2LQ9BRP1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDCD2LQ9BRP1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDCD2LQ9BRP1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDCD2LQ9BRP1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms