Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TXNDC17Q9BRA2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms