Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD3

KXD1, KxDL motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KXD1Q9BQD3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KXD1Q9BQD3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KXD1Q9BQD3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KXD1Q9BQD3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KXD1Q9BQD3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KXD1Q9BQD3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KXD1Q9BQD3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KXD1Q9BQD3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KXD1Q9BQD3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KXD1Q9BQD3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KXD1Q9BQD3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KXD1Q9BQD3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KXD1Q9BQD3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KXD1Q9BQD3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KXD1Q9BQD3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KXD1Q9BQD3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KXD1Q9BQD3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KXD1Q9BQD3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KXD1Q9BQD3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KXD1Q9BQD3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KXD1Q9BQD3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KXD1Q9BQD3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KXD1Q9BQD3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KXD1Q9BQD3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KXD1Q9BQD3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KXD1Q9BQD3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KXD1Q9BQD3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KXD1Q9BQD3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KXD1Q9BQD3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KXD1Q9BQD3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KXD1Q9BQD3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KXD1Q9BQD3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KXD1Q9BQD3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KXD1Q9BQD3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms