Protein–RNA interactions for Protein: Q96S66

CLCC1, Chloride channel CLIC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCC1Q96S66 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CLCC1Q96S66 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms