Protein–RNA interactions for Protein: Q92989

CLP1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLP1Q92989 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLP1Q92989 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLP1Q92989 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLP1Q92989 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLP1Q92989 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLP1Q92989 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLP1Q92989 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLP1Q92989 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLP1Q92989 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLP1Q92989 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLP1Q92989 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLP1Q92989 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLP1Q92989 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLP1Q92989 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLP1Q92989 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLP1Q92989 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLP1Q92989 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLP1Q92989 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CLP1Q92989 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLP1Q92989 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CLP1Q92989 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CLP1Q92989 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CLP1Q92989 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLP1Q92989 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLP1Q92989 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms