Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFT8

DNER, Delta and Notch-like epidermal growth factor-related receptor, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNERQ8NFT8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNERQ8NFT8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNERQ8NFT8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNERQ8NFT8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNERQ8NFT8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNERQ8NFT8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNERQ8NFT8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
DNERQ8NFT8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNERQ8NFT8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DNERQ8NFT8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DNERQ8NFT8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DNERQ8NFT8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DNERQ8NFT8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNERQ8NFT8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNERQ8NFT8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNERQ8NFT8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNERQ8NFT8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNERQ8NFT8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms