Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC148Q8NFR7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC148Q8NFR7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms