Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNBD1Q8NA66 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNBD1Q8NA66 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNBD1Q8NA66 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNBD1Q8NA66 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CNBD1Q8NA66 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNBD1Q8NA66 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNBD1Q8NA66 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNBD1Q8NA66 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNBD1Q8NA66 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNBD1Q8NA66 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNBD1Q8NA66 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNBD1Q8NA66 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNBD1Q8NA66 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNBD1Q8NA66 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNBD1Q8NA66 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNBD1Q8NA66 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNBD1Q8NA66 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNBD1Q8NA66 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNBD1Q8NA66 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNBD1Q8NA66 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNBD1Q8NA66 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CNBD1Q8NA66 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNBD1Q8NA66 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CNBD1Q8NA66 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CNBD1Q8NA66 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNBD1Q8NA66 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
CNBD1Q8NA66 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CNBD1Q8NA66 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CNBD1Q8NA66 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CNBD1Q8NA66 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CNBD1Q8NA66 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CNBD1Q8NA66 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CNBD1Q8NA66 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CNBD1Q8NA66 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNBD1Q8NA66 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNBD1Q8NA66 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CNBD1Q8NA66 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNBD1Q8NA66 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNBD1Q8NA66 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNBD1Q8NA66 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNBD1Q8NA66 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNBD1Q8NA66 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNBD1Q8NA66 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNBD1Q8NA66 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNBD1Q8NA66 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNBD1Q8NA66 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNBD1Q8NA66 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNBD1Q8NA66 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNBD1Q8NA66 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNBD1Q8NA66 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNBD1Q8NA66 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNBD1Q8NA66 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNBD1Q8NA66 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNBD1Q8NA66 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CNBD1Q8NA66 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNBD1Q8NA66 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNBD1Q8NA66 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNBD1Q8NA66 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNBD1Q8NA66 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CNBD1Q8NA66 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CNBD1Q8NA66 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CNBD1Q8NA66 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CNBD1Q8NA66 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CNBD1Q8NA66 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CNBD1Q8NA66 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNBD1Q8NA66 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNBD1Q8NA66 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNBD1Q8NA66 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CNBD1Q8NA66 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CNBD1Q8NA66 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNBD1Q8NA66 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNBD1Q8NA66 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNBD1Q8NA66 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNBD1Q8NA66 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNBD1Q8NA66 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNBD1Q8NA66 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNBD1Q8NA66 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNBD1Q8NA66 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CNBD1Q8NA66 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CNBD1Q8NA66 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNBD1Q8NA66 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CNBD1Q8NA66 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNBD1Q8NA66 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNBD1Q8NA66 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNBD1Q8NA66 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNBD1Q8NA66 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNBD1Q8NA66 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNBD1Q8NA66 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNBD1Q8NA66 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CNBD1Q8NA66 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CNBD1Q8NA66 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNBD1Q8NA66 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNBD1Q8NA66 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CNBD1Q8NA66 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNBD1Q8NA66 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNBD1Q8NA66 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNBD1Q8NA66 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNBD1Q8NA66 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNBD1Q8NA66 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms