Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
VPS8Q8N3P4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
VPS8Q8N3P4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
VPS8Q8N3P4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
VPS8Q8N3P4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
VPS8Q8N3P4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
VPS8Q8N3P4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
VPS8Q8N3P4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
VPS8Q8N3P4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
VPS8Q8N3P4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
VPS8Q8N3P4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
VPS8Q8N3P4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
VPS8Q8N3P4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
VPS8Q8N3P4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.02
VPS8Q8N3P4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.02
VPS8Q8N3P4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.02
VPS8Q8N3P4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
VPS8Q8N3P4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
VPS8Q8N3P4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
VPS8Q8N3P4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
VPS8Q8N3P4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
VPS8Q8N3P4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
VPS8Q8N3P4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
VPS8Q8N3P4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
VPS8Q8N3P4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
VPS8Q8N3P4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
VPS8Q8N3P4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
VPS8Q8N3P4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
VPS8Q8N3P4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
VPS8Q8N3P4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
VPS8Q8N3P4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
VPS8Q8N3P4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
VPS8Q8N3P4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
VPS8Q8N3P4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
VPS8Q8N3P4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
VPS8Q8N3P4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
VPS8Q8N3P4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
VPS8Q8N3P4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
VPS8Q8N3P4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
VPS8Q8N3P4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
VPS8Q8N3P4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
VPS8Q8N3P4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
VPS8Q8N3P4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
VPS8Q8N3P4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
VPS8Q8N3P4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
VPS8Q8N3P4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
VPS8Q8N3P4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
VPS8Q8N3P4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
VPS8Q8N3P4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
VPS8Q8N3P4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
VPS8Q8N3P4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
VPS8Q8N3P4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
VPS8Q8N3P4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
VPS8Q8N3P4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC33.9■■■■□ 3.02
VPS8Q8N3P4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
VPS8Q8N3P4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
VPS8Q8N3P4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
VPS8Q8N3P4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
VPS8Q8N3P4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
VPS8Q8N3P4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC33.89■■■■□ 3.02
VPS8Q8N3P4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
VPS8Q8N3P4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
VPS8Q8N3P4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
VPS8Q8N3P4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
VPS8Q8N3P4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
VPS8Q8N3P4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
VPS8Q8N3P4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
VPS8Q8N3P4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
VPS8Q8N3P4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
VPS8Q8N3P4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
VPS8Q8N3P4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
VPS8Q8N3P4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
VPS8Q8N3P4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
VPS8Q8N3P4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
VPS8Q8N3P4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
VPS8Q8N3P4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
VPS8Q8N3P4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
VPS8Q8N3P4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
VPS8Q8N3P4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
VPS8Q8N3P4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
VPS8Q8N3P4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
VPS8Q8N3P4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
VPS8Q8N3P4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
VPS8Q8N3P4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
VPS8Q8N3P4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
VPS8Q8N3P4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
VPS8Q8N3P4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
VPS8Q8N3P4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
VPS8Q8N3P4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
VPS8Q8N3P4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
VPS8Q8N3P4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
VPS8Q8N3P4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
VPS8Q8N3P4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
VPS8Q8N3P4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
VPS8Q8N3P4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
VPS8Q8N3P4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
VPS8Q8N3P4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
VPS8Q8N3P4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
VPS8Q8N3P4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
VPS8Q8N3P4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms