Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
YTHDF3Q7Z739 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.32■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.32■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.31■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.3■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.29■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.29■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
YTHDF3Q7Z739 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms