Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Z2

RD3, Protein RD3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3Q7Z3Z2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
RD3Q7Z3Z2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RD3Q7Z3Z2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms