Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TMUB2Q71RG4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMUB2Q71RG4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms