Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV60

LINC00173, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00173, humanhuman

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00173Q6ZV60 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00173Q6ZV60 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms