Protein–RNA interactions for Protein: Q6SZW1

SARM1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARM1Q6SZW1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SARM1Q6SZW1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SARM1Q6SZW1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SARM1Q6SZW1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SARM1Q6SZW1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SARM1Q6SZW1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SARM1Q6SZW1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SARM1Q6SZW1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SARM1Q6SZW1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SARM1Q6SZW1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SARM1Q6SZW1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SARM1Q6SZW1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SARM1Q6SZW1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SARM1Q6SZW1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SARM1Q6SZW1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SARM1Q6SZW1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SARM1Q6SZW1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SARM1Q6SZW1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SARM1Q6SZW1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SARM1Q6SZW1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SARM1Q6SZW1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SARM1Q6SZW1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SARM1Q6SZW1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SARM1Q6SZW1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SARM1Q6SZW1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SARM1Q6SZW1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SARM1Q6SZW1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SARM1Q6SZW1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SARM1Q6SZW1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SARM1Q6SZW1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SARM1Q6SZW1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SARM1Q6SZW1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SARM1Q6SZW1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SARM1Q6SZW1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SARM1Q6SZW1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SARM1Q6SZW1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SARM1Q6SZW1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SARM1Q6SZW1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SARM1Q6SZW1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SARM1Q6SZW1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms