Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LDLRAD1Q5T700 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LDLRAD1Q5T700 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LDLRAD1Q5T700 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LDLRAD1Q5T700 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LDLRAD1Q5T700 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LDLRAD1Q5T700 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LDLRAD1Q5T700 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LDLRAD1Q5T700 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LDLRAD1Q5T700 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LDLRAD1Q5T700 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LDLRAD1Q5T700 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LDLRAD1Q5T700 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LDLRAD1Q5T700 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LDLRAD1Q5T700 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LDLRAD1Q5T700 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LDLRAD1Q5T700 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LDLRAD1Q5T700 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LDLRAD1Q5T700 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LDLRAD1Q5T700 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LDLRAD1Q5T700 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LDLRAD1Q5T700 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LDLRAD1Q5T700 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LDLRAD1Q5T700 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LDLRAD1Q5T700 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LDLRAD1Q5T700 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LDLRAD1Q5T700 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LDLRAD1Q5T700 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LDLRAD1Q5T700 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LDLRAD1Q5T700 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LDLRAD1Q5T700 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LDLRAD1Q5T700 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LDLRAD1Q5T700 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LDLRAD1Q5T700 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LDLRAD1Q5T700 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LDLRAD1Q5T700 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LDLRAD1Q5T700 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LDLRAD1Q5T700 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LDLRAD1Q5T700 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LDLRAD1Q5T700 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LDLRAD1Q5T700 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LDLRAD1Q5T700 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LDLRAD1Q5T700 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LDLRAD1Q5T700 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LDLRAD1Q5T700 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LDLRAD1Q5T700 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LDLRAD1Q5T700 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LDLRAD1Q5T700 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LDLRAD1Q5T700 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LDLRAD1Q5T700 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LDLRAD1Q5T700 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LDLRAD1Q5T700 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LDLRAD1Q5T700 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LDLRAD1Q5T700 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LDLRAD1Q5T700 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LDLRAD1Q5T700 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LDLRAD1Q5T700 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LDLRAD1Q5T700 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LDLRAD1Q5T700 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LDLRAD1Q5T700 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LDLRAD1Q5T700 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LDLRAD1Q5T700 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LDLRAD1Q5T700 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LDLRAD1Q5T700 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LDLRAD1Q5T700 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LDLRAD1Q5T700 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LDLRAD1Q5T700 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LDLRAD1Q5T700 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LDLRAD1Q5T700 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LDLRAD1Q5T700 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LDLRAD1Q5T700 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LDLRAD1Q5T700 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LDLRAD1Q5T700 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms