Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZQ8

CELF3, CUGBP Elav-like family member 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF3Q5SZQ8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CELF3Q5SZQ8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CELF3Q5SZQ8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CELF3Q5SZQ8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CELF3Q5SZQ8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CELF3Q5SZQ8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CELF3Q5SZQ8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CELF3Q5SZQ8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CELF3Q5SZQ8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CELF3Q5SZQ8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CELF3Q5SZQ8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CELF3Q5SZQ8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CELF3Q5SZQ8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CELF3Q5SZQ8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CELF3Q5SZQ8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CELF3Q5SZQ8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CELF3Q5SZQ8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CELF3Q5SZQ8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CELF3Q5SZQ8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CELF3Q5SZQ8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CELF3Q5SZQ8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CELF3Q5SZQ8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CELF3Q5SZQ8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CELF3Q5SZQ8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CELF3Q5SZQ8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CELF3Q5SZQ8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CELF3Q5SZQ8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CELF3Q5SZQ8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CELF3Q5SZQ8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CELF3Q5SZQ8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CELF3Q5SZQ8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CELF3Q5SZQ8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CELF3Q5SZQ8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CELF3Q5SZQ8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CELF3Q5SZQ8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CELF3Q5SZQ8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms