Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL38Q2WGJ6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL38Q2WGJ6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL38Q2WGJ6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL38Q2WGJ6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL38Q2WGJ6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL38Q2WGJ6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL38Q2WGJ6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL38Q2WGJ6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL38Q2WGJ6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL38Q2WGJ6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL38Q2WGJ6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL38Q2WGJ6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL38Q2WGJ6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL38Q2WGJ6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL38Q2WGJ6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL38Q2WGJ6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL38Q2WGJ6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL38Q2WGJ6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL38Q2WGJ6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL38Q2WGJ6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL38Q2WGJ6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL38Q2WGJ6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL38Q2WGJ6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL38Q2WGJ6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL38Q2WGJ6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms