Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM187BQ17R55 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM187BQ17R55 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM187BQ17R55 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM187BQ17R55 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM187BQ17R55 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM187BQ17R55 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM187BQ17R55 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM187BQ17R55 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM187BQ17R55 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM187BQ17R55 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM187BQ17R55 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM187BQ17R55 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM187BQ17R55 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM187BQ17R55 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM187BQ17R55 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM187BQ17R55 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM187BQ17R55 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM187BQ17R55 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM187BQ17R55 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM187BQ17R55 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM187BQ17R55 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM187BQ17R55 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM187BQ17R55 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM187BQ17R55 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM187BQ17R55 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM187BQ17R55 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM187BQ17R55 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM187BQ17R55 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM187BQ17R55 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM187BQ17R55 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM187BQ17R55 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM187BQ17R55 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM187BQ17R55 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM187BQ17R55 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM187BQ17R55 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM187BQ17R55 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM187BQ17R55 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM187BQ17R55 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM187BQ17R55 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM187BQ17R55 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM187BQ17R55 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM187BQ17R55 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM187BQ17R55 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM187BQ17R55 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM187BQ17R55 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM187BQ17R55 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM187BQ17R55 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM187BQ17R55 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM187BQ17R55 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM187BQ17R55 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM187BQ17R55 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM187BQ17R55 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM187BQ17R55 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM187BQ17R55 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM187BQ17R55 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM187BQ17R55 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM187BQ17R55 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM187BQ17R55 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM187BQ17R55 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM187BQ17R55 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM187BQ17R55 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM187BQ17R55 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM187BQ17R55 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM187BQ17R55 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM187BQ17R55 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM187BQ17R55 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM187BQ17R55 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FAM187BQ17R55 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FAM187BQ17R55 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM187BQ17R55 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM187BQ17R55 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM187BQ17R55 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM187BQ17R55 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM187BQ17R55 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM187BQ17R55 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM187BQ17R55 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM187BQ17R55 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM187BQ17R55 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM187BQ17R55 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM187BQ17R55 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM187BQ17R55 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM187BQ17R55 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM187BQ17R55 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM187BQ17R55 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM187BQ17R55 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM187BQ17R55 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM187BQ17R55 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM187BQ17R55 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM187BQ17R55 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM187BQ17R55 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM187BQ17R55 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM187BQ17R55 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM187BQ17R55 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM187BQ17R55 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM187BQ17R55 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM187BQ17R55 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM187BQ17R55 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM187BQ17R55 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM187BQ17R55 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms