Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UPP1Q16831 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UPP1Q16831 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UPP1Q16831 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UPP1Q16831 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UPP1Q16831 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UPP1Q16831 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UPP1Q16831 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UPP1Q16831 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UPP1Q16831 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UPP1Q16831 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
UPP1Q16831 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UPP1Q16831 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UPP1Q16831 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UPP1Q16831 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UPP1Q16831 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UPP1Q16831 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UPP1Q16831 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UPP1Q16831 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
UPP1Q16831 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
UPP1Q16831 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UPP1Q16831 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UPP1Q16831 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UPP1Q16831 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UPP1Q16831 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UPP1Q16831 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UPP1Q16831 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UPP1Q16831 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UPP1Q16831 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UPP1Q16831 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UPP1Q16831 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UPP1Q16831 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UPP1Q16831 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms