Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
PPP1R3AQ16821 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPP1R3AQ16821 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPP1R3AQ16821 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPP1R3AQ16821 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PPP1R3AQ16821 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PPP1R3AQ16821 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPP1R3AQ16821 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPP1R3AQ16821 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPP1R3AQ16821 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPP1R3AQ16821 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPP1R3AQ16821 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
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