Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRF1Q16656 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRF1Q16656 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRF1Q16656 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRF1Q16656 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRF1Q16656 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NRF1Q16656 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NRF1Q16656 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRF1Q16656 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRF1Q16656 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRF1Q16656 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRF1Q16656 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRF1Q16656 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRF1Q16656 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
NRF1Q16656 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NRF1Q16656 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NRF1Q16656 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NRF1Q16656 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NRF1Q16656 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NRF1Q16656 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NRF1Q16656 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NRF1Q16656 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NRF1Q16656 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NRF1Q16656 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NRF1Q16656 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NRF1Q16656 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NRF1Q16656 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NRF1Q16656 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NRF1Q16656 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NRF1Q16656 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NRF1Q16656 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NRF1Q16656 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NRF1Q16656 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NRF1Q16656 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NRF1Q16656 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NRF1Q16656 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NRF1Q16656 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NRF1Q16656 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NRF1Q16656 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NRF1Q16656 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NRF1Q16656 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NRF1Q16656 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NRF1Q16656 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NRF1Q16656 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NRF1Q16656 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NRF1Q16656 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NRF1Q16656 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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NRF1Q16656 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NRF1Q16656 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NRF1Q16656 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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NRF1Q16656 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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NRF1Q16656 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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NRF1Q16656 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NRF1Q16656 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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NRF1Q16656 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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NRF1Q16656 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRF1Q16656 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRF1Q16656 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRF1Q16656 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRF1Q16656 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRF1Q16656 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRF1Q16656 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRF1Q16656 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRF1Q16656 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NRF1Q16656 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NRF1Q16656 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NRF1Q16656 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NRF1Q16656 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NRF1Q16656 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NRF1Q16656 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NRF1Q16656 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NRF1Q16656 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NRF1Q16656 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NRF1Q16656 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NRF1Q16656 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
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