Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNAPC1Q16533 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNAPC1Q16533 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
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