Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CHRNA2Q15822 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
CHRNA2Q15822 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CHRNA2Q15822 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHRNA2Q15822 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHRNA2Q15822 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHRNA2Q15822 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHRNA2Q15822 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHRNA2Q15822 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CHRNA2Q15822 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHRNA2Q15822 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHRNA2Q15822 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CHRNA2Q15822 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CHRNA2Q15822 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CHRNA2Q15822 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHRNA2Q15822 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHRNA2Q15822 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHRNA2Q15822 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHRNA2Q15822 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHRNA2Q15822 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHRNA2Q15822 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHRNA2Q15822 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHRNA2Q15822 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHRNA2Q15822 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHRNA2Q15822 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CHRNA2Q15822 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHRNA2Q15822 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHRNA2Q15822 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHRNA2Q15822 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHRNA2Q15822 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CHRNA2Q15822 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHRNA2Q15822 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHRNA2Q15822 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHRNA2Q15822 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHRNA2Q15822 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHRNA2Q15822 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHRNA2Q15822 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHRNA2Q15822 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHRNA2Q15822 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHRNA2Q15822 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHRNA2Q15822 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHRNA2Q15822 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHRNA2Q15822 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHRNA2Q15822 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CHRNA2Q15822 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHRNA2Q15822 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHRNA2Q15822 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHRNA2Q15822 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHRNA2Q15822 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CHRNA2Q15822 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CHRNA2Q15822 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CHRNA2Q15822 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CHRNA2Q15822 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CHRNA2Q15822 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHRNA2Q15822 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHRNA2Q15822 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHRNA2Q15822 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHRNA2Q15822 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHRNA2Q15822 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHRNA2Q15822 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHRNA2Q15822 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CHRNA2Q15822 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHRNA2Q15822 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHRNA2Q15822 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHRNA2Q15822 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHRNA2Q15822 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHRNA2Q15822 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHRNA2Q15822 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHRNA2Q15822 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CHRNA2Q15822 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHRNA2Q15822 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHRNA2Q15822 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHRNA2Q15822 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHRNA2Q15822 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHRNA2Q15822 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHRNA2Q15822 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHRNA2Q15822 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHRNA2Q15822 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHRNA2Q15822 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHRNA2Q15822 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHRNA2Q15822 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHRNA2Q15822 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHRNA2Q15822 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHRNA2Q15822 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHRNA2Q15822 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHRNA2Q15822 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHRNA2Q15822 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHRNA2Q15822 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHRNA2Q15822 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHRNA2Q15822 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHRNA2Q15822 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHRNA2Q15822 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHRNA2Q15822 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CHRNA2Q15822 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHRNA2Q15822 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHRNA2Q15822 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHRNA2Q15822 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHRNA2Q15822 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CHRNA2Q15822 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHRNA2Q15822 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms