Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERPUD1Q15011 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERPUD1Q15011 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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