Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
SHPRHQ149N8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SHPRHQ149N8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SHPRHQ149N8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SHPRHQ149N8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SHPRHQ149N8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SHPRHQ149N8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SHPRHQ149N8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SHPRHQ149N8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SHPRHQ149N8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SHPRHQ149N8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SHPRHQ149N8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SHPRHQ149N8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SHPRHQ149N8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SHPRHQ149N8 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SHPRHQ149N8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SHPRHQ149N8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SHPRHQ149N8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
SHPRHQ149N8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SHPRHQ149N8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
SHPRHQ149N8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SHPRHQ149N8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SHPRHQ149N8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SHPRHQ149N8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SHPRHQ149N8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SHPRHQ149N8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
SHPRHQ149N8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SHPRHQ149N8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SHPRHQ149N8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SHPRHQ149N8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
SHPRHQ149N8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
SHPRHQ149N8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
SHPRHQ149N8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
SHPRHQ149N8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
SHPRHQ149N8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
SHPRHQ149N8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
SHPRHQ149N8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SHPRHQ149N8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SHPRHQ149N8 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SHPRHQ149N8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SHPRHQ149N8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SHPRHQ149N8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SHPRHQ149N8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SHPRHQ149N8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SHPRHQ149N8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SHPRHQ149N8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
SHPRHQ149N8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC30■■■□□ 2.39
SHPRHQ149N8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SHPRHQ149N8 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SHPRHQ149N8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SHPRHQ149N8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SHPRHQ149N8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SHPRHQ149N8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SHPRHQ149N8 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SHPRHQ149N8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SHPRHQ149N8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SHPRHQ149N8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SHPRHQ149N8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SHPRHQ149N8 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SHPRHQ149N8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SHPRHQ149N8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SHPRHQ149N8 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
SHPRHQ149N8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SHPRHQ149N8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SHPRHQ149N8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SHPRHQ149N8 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SHPRHQ149N8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SHPRHQ149N8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SHPRHQ149N8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SHPRHQ149N8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SHPRHQ149N8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SHPRHQ149N8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SHPRHQ149N8 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SHPRHQ149N8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SHPRHQ149N8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SHPRHQ149N8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SHPRHQ149N8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SHPRHQ149N8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SHPRHQ149N8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SHPRHQ149N8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SHPRHQ149N8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SHPRHQ149N8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SHPRHQ149N8 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SHPRHQ149N8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SHPRHQ149N8 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SHPRHQ149N8 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
SHPRHQ149N8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SHPRHQ149N8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SHPRHQ149N8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SHPRHQ149N8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SHPRHQ149N8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SHPRHQ149N8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SHPRHQ149N8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SHPRHQ149N8 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SHPRHQ149N8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
SHPRHQ149N8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
SHPRHQ149N8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SHPRHQ149N8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SHPRHQ149N8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SHPRHQ149N8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
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