Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNFAIP1Q13829 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNFAIP1Q13829 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNFAIP1Q13829 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TNFAIP1Q13829 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNFAIP1Q13829 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TNFAIP1Q13829 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNFAIP1Q13829 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNFAIP1Q13829 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNFAIP1Q13829 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNFAIP1Q13829 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNFAIP1Q13829 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNFAIP1Q13829 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNFAIP1Q13829 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TNFAIP1Q13829 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TNFAIP1Q13829 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TNFAIP1Q13829 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNFAIP1Q13829 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNFAIP1Q13829 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNFAIP1Q13829 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNFAIP1Q13829 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNFAIP1Q13829 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNFAIP1Q13829 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNFAIP1Q13829 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TNFAIP1Q13829 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNFAIP1Q13829 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNFAIP1Q13829 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNFAIP1Q13829 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNFAIP1Q13829 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNFAIP1Q13829 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNFAIP1Q13829 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNFAIP1Q13829 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNFAIP1Q13829 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNFAIP1Q13829 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNFAIP1Q13829 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNFAIP1Q13829 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNFAIP1Q13829 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNFAIP1Q13829 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNFAIP1Q13829 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNFAIP1Q13829 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNFAIP1Q13829 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNFAIP1Q13829 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNFAIP1Q13829 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNFAIP1Q13829 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNFAIP1Q13829 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNFAIP1Q13829 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNFAIP1Q13829 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNFAIP1Q13829 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNFAIP1Q13829 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNFAIP1Q13829 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TNFAIP1Q13829 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNFAIP1Q13829 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNFAIP1Q13829 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNFAIP1Q13829 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNFAIP1Q13829 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNFAIP1Q13829 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNFAIP1Q13829 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TNFAIP1Q13829 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNFAIP1Q13829 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TNFAIP1Q13829 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNFAIP1Q13829 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNFAIP1Q13829 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNFAIP1Q13829 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNFAIP1Q13829 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNFAIP1Q13829 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNFAIP1Q13829 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNFAIP1Q13829 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNFAIP1Q13829 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNFAIP1Q13829 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNFAIP1Q13829 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNFAIP1Q13829 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNFAIP1Q13829 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNFAIP1Q13829 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNFAIP1Q13829 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNFAIP1Q13829 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNFAIP1Q13829 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNFAIP1Q13829 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNFAIP1Q13829 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNFAIP1Q13829 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNFAIP1Q13829 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TNFAIP1Q13829 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNFAIP1Q13829 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TNFAIP1Q13829 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNFAIP1Q13829 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNFAIP1Q13829 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNFAIP1Q13829 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNFAIP1Q13829 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNFAIP1Q13829 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
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