Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SNTA1Q13424 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNTA1Q13424 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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