Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLN3Q13286 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLN3Q13286 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLN3Q13286 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLN3Q13286 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLN3Q13286 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLN3Q13286 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLN3Q13286 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CLN3Q13286 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CLN3Q13286 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLN3Q13286 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLN3Q13286 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLN3Q13286 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLN3Q13286 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLN3Q13286 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLN3Q13286 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLN3Q13286 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLN3Q13286 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLN3Q13286 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CLN3Q13286 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLN3Q13286 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLN3Q13286 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLN3Q13286 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLN3Q13286 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLN3Q13286 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLN3Q13286 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLN3Q13286 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLN3Q13286 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLN3Q13286 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLN3Q13286 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLN3Q13286 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLN3Q13286 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLN3Q13286 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CLN3Q13286 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLN3Q13286 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLN3Q13286 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLN3Q13286 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLN3Q13286 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLN3Q13286 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CLN3Q13286 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLN3Q13286 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
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