Protein–RNA interactions for Protein: Q08960

TYW1, S-adenosyl-L-methionine-dependent tRNA 4-demethylwyosine synthase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TYW1Q08960 SAT4YCR008W 1812 nt6.31□□□□□ -1.4
TYW1Q08960 ARG4YHR018C 1392 nt6.31□□□□□ -1.4
TYW1Q08960 ALT2YDR111C 1524 nt6.3□□□□□ -1.4
TYW1Q08960 YER046W-AYER046W-A 330 nt6.3□□□□□ -1.4
TYW1Q08960 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt6.3□□□□□ -1.4
TYW1Q08960 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt6.3□□□□□ -1.4
TYW1Q08960 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt6.3□□□□□ -1.4
TYW1Q08960 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt6.3□□□□□ -1.4
TYW1Q08960 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt6.3□□□□□ -1.4
TYW1Q08960 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt6.3□□□□□ -1.4
TYW1Q08960 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt6.3□□□□□ -1.4
TYW1Q08960 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt6.3□□□□□ -1.4
TYW1Q08960 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt6.3□□□□□ -1.4
TYW1Q08960 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt6.3□□□□□ -1.4
TYW1Q08960 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt6.3□□□□□ -1.4
TYW1Q08960 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt6.3□□□□□ -1.4
TYW1Q08960 YNL043CYNL043C 321 nt6.3□□□□□ -1.4
TYW1Q08960 YPS7YDR349C 1791 nt6.3□□□□□ -1.4
TYW1Q08960 PGM1YKL127W 1713 nt6.3□□□□□ -1.4
TYW1Q08960 GSH1YJL101C 2037 nt6.3□□□□□ -1.4
TYW1Q08960 CDC4YFL009W 2340 nt6.3□□□□□ -1.4
TYW1Q08960 BUD7YOR299W 2241 nt6.29□□□□□ -1.4
TYW1Q08960 HMRA2YCR096C 360 nt6.29□□□□□ -1.4
TYW1Q08960 RXT3YDL076C 885 nt6.29□□□□□ -1.4
TYW1Q08960 BNA7YDR428C 786 nt6.29□□□□□ -1.4
TYW1Q08960 PHO8YDR481C 1701 nt6.29□□□□□ -1.4
TYW1Q08960 YER079WYER079W 633 nt6.29□□□□□ -1.4
TYW1Q08960 YAP5YIR018W 738 nt6.29□□□□□ -1.4
TYW1Q08960 YOL159CYOL159C 516 nt6.29□□□□□ -1.4
TYW1Q08960 PEP12YOR036W 867 nt6.29□□□□□ -1.4
TYW1Q08960 GRX7YBR014C 612 nt6.29□□□□□ -1.4
TYW1Q08960 snR41snR41 95 nt6.29□□□□□ -1.4
TYW1Q08960 SFB3YHR098C 2790 nt6.29□□□□□ -1.4
TYW1Q08960 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt6.28□□□□□ -1.4
TYW1Q08960 GPT2YKR067W 2232 nt6.28□□□□□ -1.4
TYW1Q08960 YCR013CYCR013C 648 nt6.28□□□□□ -1.4
TYW1Q08960 RRP42YDL111C 798 nt6.28□□□□□ -1.4
TYW1Q08960 HSP12YFL014W 330 nt6.28□□□□□ -1.4
TYW1Q08960 RPL9AYGL147C 576 nt6.28□□□□□ -1.4
TYW1Q08960 ECL1YGR146C 636 nt6.28□□□□□ -1.4
TYW1Q08960 YIL156W-AYIL156W-A 402 nt6.28□□□□□ -1.4
TYW1Q08960 YJR012CYJR012C 624 nt6.28□□□□□ -1.4
TYW1Q08960 YLR290CYLR290C 834 nt6.28□□□□□ -1.4
TYW1Q08960 MCK1YNL307C 1128 nt6.28□□□□□ -1.4
TYW1Q08960 MIH1YMR036C 1665 nt6.28□□□□□ -1.4
TYW1Q08960 RKM3YBR030W 1659 nt6.28□□□□□ -1.4
TYW1Q08960 MDM34YGL219C 1380 nt6.28□□□□□ -1.4
TYW1Q08960 YMR111CYMR111C 1389 nt6.28□□□□□ -1.4
TYW1Q08960 HXT2YMR011W 1626 nt6.28□□□□□ -1.4
TYW1Q08960 SOF1YLL011W 1470 nt6.28□□□□□ -1.4
TYW1Q08960 PHO90YJL198W 2646 nt6.28□□□□□ -1.4
TYW1Q08960 ASF2YDL197C 1578 nt6.27□□□□□ -1.41
TYW1Q08960 RAD28YDR030C 1521 nt6.27□□□□□ -1.41
TYW1Q08960 YDL187CYDL187C 330 nt6.27□□□□□ -1.41
TYW1Q08960 YER076CYER076C 909 nt6.27□□□□□ -1.41
TYW1Q08960 Q0143Q0143 153 nt6.27□□□□□ -1.41
TYW1Q08960 ADI1YMR009W 540 nt6.27□□□□□ -1.41
TYW1Q08960 RPS15YOL040C 429 nt6.27□□□□□ -1.41
TYW1Q08960 AFR1YDR085C 1863 nt6.27□□□□□ -1.41
TYW1Q08960 ECM38YLR299W 1983 nt6.27□□□□□ -1.41
TYW1Q08960 SSA2YLL024C 1920 nt6.27□□□□□ -1.41
TYW1Q08960 YTA12YMR089C 2478 nt6.26□□□□□ -1.41
TYW1Q08960 POP1YNL221C 2628 nt6.26□□□□□ -1.41
TYW1Q08960 RPA14YDR156W 414 nt6.26□□□□□ -1.41
TYW1Q08960 YER087C-AYER087C-A 552 nt6.26□□□□□ -1.41
TYW1Q08960 YGR039WYGR039W 312 nt6.26□□□□□ -1.41
TYW1Q08960 YGR127WYGR127W 939 nt6.26□□□□□ -1.41
TYW1Q08960 YKT6YKL196C 603 nt6.26□□□□□ -1.41
TYW1Q08960 SDO1YLR022C 753 nt6.26□□□□□ -1.41
TYW1Q08960 YBL010CYBL010C 843 nt6.26□□□□□ -1.41
TYW1Q08960 YRO2YBR054W 1035 nt6.26□□□□□ -1.41
TYW1Q08960 JIP5YPR169W 1479 nt6.26□□□□□ -1.41
TYW1Q08960 YCT1YLL055W 1596 nt6.26□□□□□ -1.41
TYW1Q08960 HCM1YCR065W 1695 nt6.26□□□□□ -1.41
TYW1Q08960 GEM1YAL048C 1989 nt6.26□□□□□ -1.41
TYW1Q08960 RNT1YMR239C 1416 nt6.25□□□□□ -1.41
TYW1Q08960 AZR1YGR224W 1842 nt6.25□□□□□ -1.41
TYW1Q08960 PBP4YDL053C 558 nt6.25□□□□□ -1.41
TYW1Q08960 SCW4YGR279C 1161 nt6.25□□□□□ -1.41
TYW1Q08960 COA1YIL157C 594 nt6.25□□□□□ -1.41
TYW1Q08960 YJL169WYJL169W 369 nt6.25□□□□□ -1.41
TYW1Q08960 UBI4YLL039C 1146 nt6.25□□□□□ -1.41
TYW1Q08960 COX5AYNL052W 462 nt6.25□□□□□ -1.41
TYW1Q08960 YPR170CYPR170C 336 nt6.25□□□□□ -1.41
TYW1Q08960 PES4YFR023W 1836 nt6.25□□□□□ -1.41
TYW1Q08960 LDB19YOR322C 2457 nt6.24□□□□□ -1.41
TYW1Q08960 FAT3YKL187C 2253 nt6.24□□□□□ -1.41
TYW1Q08960 snR8snR8 190 nt6.24□□□□□ -1.41
TYW1Q08960 YER175W-AYER175W-A 165 nt6.24□□□□□ -1.41
TYW1Q08960 YIL021C-AYIL021C-A 270 nt6.24□□□□□ -1.41
TYW1Q08960 VPS1YKR001C 2115 nt6.24□□□□□ -1.41
TYW1Q08960 RAD33YML011C 534 nt6.24□□□□□ -1.41
TYW1Q08960 MCM1YMR043W 861 nt6.24□□□□□ -1.41
TYW1Q08960 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt6.24□□□□□ -1.41
TYW1Q08960 SWS2YNL081C 432 nt6.24□□□□□ -1.41
TYW1Q08960 MSN1YOL116W 1149 nt6.24□□□□□ -1.41
TYW1Q08960 PCS60YBR222C 1632 nt6.24□□□□□ -1.41
TYW1Q08960 YRF1-4YLR466W 4149 nt6.24□□□□□ -1.41
TYW1Q08960 CDC5YMR001C 2118 nt6.23□□□□□ -1.41
TYW1Q08960 LAP3YNL239W 1365 nt6.23□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 88.4 ms