Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD300CQ08708 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms