Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SCN1BQ07699 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SCN1BQ07699 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SCN1BQ07699 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms