Protein–RNA interactions for Protein: P53999

SUB1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUB1P53999 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.284e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.24e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.24e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.184e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.154e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 ANO9-207ENST00000532094 5487 ntTSL 215.91■□□□□ 0.144e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.134e-6■■■■■ 28.5
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SUB1P53999 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.084e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 HDHD5-207ENST00000486462 1591 ntTSL 215.45■□□□□ 0.064e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 SCARB1-205ENST00000538291 5527 ntTSL 515.4■□□□□ 0.064e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.054e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.054e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.044e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.034e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.034e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.014e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.034e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 BAIAP2-225ENST00000576225 2316 ntTSL 214.79□□□□□ -0.044e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 POMT1-202ENST00000372220 1741 ntTSL 514.66□□□□□ -0.064e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.094e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.124e-6■■■■■ 28.5
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SUB1P53999 SELENBP1-207ENST00000443708 1724 ntTSL 513.93□□□□□ -0.184e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.194e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.214e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.224e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.224e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.234e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.244e-6■■■■■ 28.5
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SUB1P53999 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.294e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 ANO9-206ENST00000528927 2639 ntTSL 1 (best)13.19□□□□□ -0.34e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.324e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.334e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 SNX5-214ENST00000490175 2025 ntTSL 1 (best)12.99□□□□□ -0.334e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.344e-6■■■■■ 28.5
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SUB1P53999 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.444e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 BAIAP2-210ENST00000572498 858 ntTSL 212.32□□□□□ -0.444e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 AGTRAP-210ENST00000491346 1116 ntTSL 512.25□□□□□ -0.454e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.484e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.54e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.534e-6■■■■■ 28.5
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SUB1P53999 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.594e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 SELENBP1-202ENST00000423070 1887 ntTSL 511.37□□□□□ -0.594e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.614e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 WWP2-202ENST00000359154 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.634e-6■■■■■ 28.5
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SUB1P53999 AGTRAP-214ENST00000514733 919 ntTSL 310.42□□□□□ -0.744e-6■■■■■ 28.5
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SUB1P53999 WWP2-201ENST00000356003 4227 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.764e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 TMEM8A-205ENST00000448854 858 ntTSL 210.05□□□□□ -0.84e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 PARN-203ENST00000437198 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.814e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 AGTRAP-213ENST00000513739 566 ntTSL 39.91□□□□□ -0.824e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 SELENBP1-216ENST00000474352 2840 ntTSL 29.89□□□□□ -0.834e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 DPP3-205ENST00000530165 2251 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.854e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 DPP3-203ENST00000526515 547 ntTSL 39.61□□□□□ -0.874e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 SCARB1-204ENST00000535005 1845 ntTSL 1 (best)9.59□□□□□ -0.884e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 POMT1-215ENST00000485278 3420 ntTSL 29.17□□□□□ -0.944e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 RAB11A-207ENST00000568850 551 ntTSL 49.07□□□□□ -0.964e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 HDHD5-205ENST00000477157 3614 ntTSL 1 (best)9.06□□□□□ -0.964e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 CARS-206ENST00000465240 658 ntTSL 29.01□□□□□ -0.974e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 DPP3-216ENST00000544603 566 ntTSL 59□□□□□ -0.974e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 RAB11A-204ENST00000565075 711 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.994e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 RAB11A-205ENST00000566233 588 ntTSL 48.86□□□□□ -0.994e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 TMEM8A-206ENST00000467452 646 ntTSL 28.76□□□□□ -1.014e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 PLXND1-216ENST00000514990 1084 ntTSL 28.7□□□□□ -1.024e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 SELENBP1-209ENST00000455397 1521 ntTSL 58.69□□□□□ -1.024e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 WWP2-213ENST00000568684 3672 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.034e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 BLVRA-201ENST00000265523 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.074e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 DPP3-212ENST00000533725 595 ntTSL 48.32□□□□□ -1.084e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 LAMTOR1-204ENST00000538404 1346 ntTSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.14e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 LAMTOR1-202ENST00000535107 619 ntTSL 3 BASIC8.13□□□□□ -1.114e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 SMARCD1-205ENST00000548573 2095 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.134e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 AGAP3-212ENST00000473633 3751 ntTSL 1 (best)7.83□□□□□ -1.164e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 LAMTOR1-208ENST00000545249 965 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.164e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 SMARCD1-206ENST00000549274 611 ntTSL 37.74□□□□□ -1.174e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 DPP3-210ENST00000532019 561 ntTSL 47.72□□□□□ -1.174e-6■■■■■ 28.5
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