Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC39.16■■■■□ 3.86
SMARCA4P51532 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
SMARCA4P51532 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
SMARCA4P51532 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC39.15■■■■□ 3.86
SMARCA4P51532 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC39.15■■■■□ 3.86
SMARCA4P51532 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
SMARCA4P51532 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
SMARCA4P51532 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.15■■■■□ 3.86
SMARCA4P51532 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
SMARCA4P51532 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
SMARCA4P51532 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
SMARCA4P51532 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
SMARCA4P51532 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
SMARCA4P51532 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
SMARCA4P51532 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
SMARCA4P51532 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
SMARCA4P51532 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC39.14■■■■□ 3.86
SMARCA4P51532 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
SMARCA4P51532 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.86
SMARCA4P51532 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.85
SMARCA4P51532 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC39.13■■■■□ 3.85
SMARCA4P51532 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
SMARCA4P51532 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.85
SMARCA4P51532 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
SMARCA4P51532 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
SMARCA4P51532 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
SMARCA4P51532 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC39.13■■■■□ 3.85
SMARCA4P51532 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
SMARCA4P51532 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
SMARCA4P51532 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
SMARCA4P51532 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
SMARCA4P51532 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
SMARCA4P51532 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC39.12■■■■□ 3.85
SMARCA4P51532 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
SMARCA4P51532 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
SMARCA4P51532 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
SMARCA4P51532 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
SMARCA4P51532 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
SMARCA4P51532 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
SMARCA4P51532 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
SMARCA4P51532 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
SMARCA4P51532 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
SMARCA4P51532 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
SMARCA4P51532 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC39.11■■■■□ 3.85
SMARCA4P51532 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
SMARCA4P51532 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
SMARCA4P51532 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
SMARCA4P51532 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
SMARCA4P51532 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
SMARCA4P51532 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC39.1■■■■□ 3.85
SMARCA4P51532 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
SMARCA4P51532 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
SMARCA4P51532 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC39.1■■■■□ 3.85
SMARCA4P51532 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC39.1■■■■□ 3.85
SMARCA4P51532 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC39.1■■■■□ 3.85
SMARCA4P51532 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC39.1■■■■□ 3.85
SMARCA4P51532 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
SMARCA4P51532 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
SMARCA4P51532 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
SMARCA4P51532 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
SMARCA4P51532 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
SMARCA4P51532 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
SMARCA4P51532 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
SMARCA4P51532 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
SMARCA4P51532 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
SMARCA4P51532 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC39.08■■■■□ 3.85
SMARCA4P51532 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC39.08■■■■□ 3.85
SMARCA4P51532 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
SMARCA4P51532 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC39.07■■■■□ 3.85
SMARCA4P51532 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
SMARCA4P51532 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC39.07■■■■□ 3.85
SMARCA4P51532 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
SMARCA4P51532 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
SMARCA4P51532 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.84
SMARCA4P51532 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC39.07■■■■□ 3.84
SMARCA4P51532 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.07■■■■□ 3.84
SMARCA4P51532 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
SMARCA4P51532 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
SMARCA4P51532 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC39.06■■■■□ 3.84
SMARCA4P51532 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.06■■■■□ 3.84
SMARCA4P51532 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
SMARCA4P51532 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
SMARCA4P51532 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
SMARCA4P51532 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC39.05■■■■□ 3.84
SMARCA4P51532 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
SMARCA4P51532 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
SMARCA4P51532 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
SMARCA4P51532 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
SMARCA4P51532 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
SMARCA4P51532 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC39.04■■■■□ 3.84
SMARCA4P51532 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC39.04■■■■□ 3.84
SMARCA4P51532 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC39.04■■■■□ 3.84
SMARCA4P51532 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
SMARCA4P51532 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
SMARCA4P51532 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
SMARCA4P51532 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC39.03■■■■□ 3.84
SMARCA4P51532 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
SMARCA4P51532 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
SMARCA4P51532 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
SMARCA4P51532 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms