Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIA2P42262 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIA2P42262 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms