Protein–RNA interactions for Protein: P40313

CTRL, Chymotrypsin-like protease CTRL-1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRLP40313 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRLP40313 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRLP40313 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRLP40313 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRLP40313 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRLP40313 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRLP40313 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRLP40313 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRLP40313 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRLP40313 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRLP40313 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRLP40313 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTRLP40313 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTRLP40313 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTRLP40313 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTRLP40313 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTRLP40313 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTRLP40313 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTRLP40313 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTRLP40313 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTRLP40313 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTRLP40313 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTRLP40313 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CTRLP40313 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTRLP40313 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTRLP40313 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTRLP40313 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTRLP40313 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTRLP40313 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTRLP40313 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTRLP40313 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CTRLP40313 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTRLP40313 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTRLP40313 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CTRLP40313 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTRLP40313 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTRLP40313 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTRLP40313 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTRLP40313 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTRLP40313 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTRLP40313 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CTRLP40313 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTRLP40313 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTRLP40313 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTRLP40313 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTRLP40313 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTRLP40313 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTRLP40313 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTRLP40313 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTRLP40313 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTRLP40313 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CTRLP40313 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTRLP40313 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTRLP40313 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTRLP40313 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTRLP40313 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTRLP40313 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTRLP40313 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTRLP40313 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTRLP40313 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CTRLP40313 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTRLP40313 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CTRLP40313 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTRLP40313 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTRLP40313 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTRLP40313 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTRLP40313 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTRLP40313 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTRLP40313 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTRLP40313 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTRLP40313 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTRLP40313 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTRLP40313 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CTRLP40313 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTRLP40313 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTRLP40313 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CTRLP40313 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CTRLP40313 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTRLP40313 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTRLP40313 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTRLP40313 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTRLP40313 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTRLP40313 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTRLP40313 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTRLP40313 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTRLP40313 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTRLP40313 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTRLP40313 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTRLP40313 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTRLP40313 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTRLP40313 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTRLP40313 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTRLP40313 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTRLP40313 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTRLP40313 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTRLP40313 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTRLP40313 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTRLP40313 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTRLP40313 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CTRLP40313 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms